为应对新型冠状病毒肺炎疫情,为我市传染病病原快速鉴定和溯源提供高端技术平台,市疾病预防控制中心先后购置了illumina iseq100测序系统、Oxford Nanopore测序仪及相关分析软件。两个多月来,卫生检验科技术团队努力探索,先后攻克全基因组提取、文库制备、上机测序与数据比对分析等各项环节,成功建立了高通量测序(NGS)技术平台。
基因组测序是研究疾病流行的重要工具,通过对不同病原进行全基因组测序,获得的测序数据使用相关分析软件和国家致病菌识别网分析,揭示各类病原微生物在基因组层面变化,有利于对各种感染性疾病病原体进行溯源和监测分析,有利于对突发疫情进行科学研判、精准防控。
全基因组测序获得成功后,实验室工作人员也掌握了全基因组测序的操作流程及测序结果分析技术,这标志着新冠肺炎疫情之后临沂市疾控实验室检测能力再次提升,为我市更准确地进行病原溯源和流行病学调查提供保障和支持。
(卫生检验科 李涛)