乙型流感与甲型流感的临床症状相似，主要表现为发热、头痛、肌肉酸痛等，在老年人和儿童中也会引起继发致死性肺炎等。

但是，乙型流感的症状大多数较甲型流感轻，曾有研究者做过统计，乙型流感的住院率仅为甲型流感的1/4，与甲型流感相比，乙型流感更容易导致病毒性肌炎和胃肠道症状。

在我国部分城市的调查中，乙型流感高热的比例还高于甲型流感。